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│ │ │ │
Module dependency graph
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│ │ │ │
│ │ │ │

The graph below shows the dependencies between the source code modules, computed from include statements in the code. For documented modules (those that do not have a gray background), clicking on the module takes you to the module documentation. Legend for the graph can be found below the graph.

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│ │ │ │ -
│ │ │ │ +
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│ │ │ │ Legend

│ │ │ │

The graph below annotates the colors and line styles used in the module dependency graph above. More detailed textual annotation is below the graph.

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Node colors:

│ │ │ │
gray background
│ │ │ ├── ./usr/share/doc/gromacs/html/manual-2024.1-Debian_2024.1_1.pdf │ │ │ │ ├── pdftotext {} - │ │ │ │ │ @@ -17628,15 +17628,15 @@ │ │ │ │ │ Dimitrios Karkoulis, Peter Kasson, Sebastian Kehl, Sebastian Keller, Jiri Kraus, Per Larsson, Viveca Lindahl, │ │ │ │ │ Erik Marklund, Pieter Meulenhoff, Teemu Murtola, Sander Pronk, Michael Shirts, Alfons Sijbers, Balint Soproni, David van der Spoel, Peter Tieleman, Carsten Uphoff, Jon Vincent, Teemu Virolainen, Christian Wennberg, │ │ │ │ │ Maarten Wolf, Artem Zhmurov │ │ │ │ │ Project leaders: Berk Hess, Erik Lindahl │ │ │ │ │ © 1991 – 2000: │ │ │ │ │ Department of Biophysical Chemistry, University of Groningen. Nijenborgh 4, 9747 AG Groningen, │ │ │ │ │ The Netherlands. │ │ │ │ │ -© 2001 – 2025: │ │ │ │ │ +© 2001 – 2024: │ │ │ │ │ The GROMACS development teams at the Royal Institute of Technology and Uppsala University, │ │ │ │ │ Sweden. │ │ │ │ │ This manual is not complete and has no pretension to be so due to lack of time of the contributors – our first │ │ │ │ │ priority is to improve the software. It is worked on continuously, which in some cases might mean the information │ │ │ │ │ is not entirely correct. │ │ │ │ │ Comments on form and content are welcome, please send them to the user discussion forum or the developer │ │ │ │ │ discussion forum (see our webpage or this section on how to contribute (page 620)), or open an issue on our issue │ │ │ ├── ./usr/share/doc/gromacs/html/reference-manual/preface.html │ │ │ │ @@ -4115,15 +4115,15 @@ │ │ │ │ 00010120: 2c20 556e 6976 6572 7369 7479 206f 6620 , University of │ │ │ │ 00010130: 4772 6f6e 696e 6765 6e2e 0a4e 696a 656e Groningen..Nijen │ │ │ │ 00010140: 626f 7267 6820 342c 2039 3734 3720 4147 borgh 4, 9747 AG │ │ │ │ 00010150: 2047 726f 6e69 6e67 656e 2c20 5468 6520 Groningen, The │ │ │ │ 00010160: 4e65 7468 6572 6c61 6e64 732e 3c2f 703e Netherlands.

│ │ │ │ 00010170: 0a3c 2f64 6976 3e3c 2f62 6c6f 636b 7175 .
.

.. 2001 │ │ │ │ -00010190: e280 9320 3230 3235 3a3c 2f70 3e0a 3c62 ... 2025:

...
│ │ │ │ 000101b0: 3c70 3e54 6865 2047 524f 4d41 4353 2064

The GROMACS d │ │ │ │ 000101c0: 6576 656c 6f70 6d65 6e74 2074 6561 6d73 evelopment teams │ │ │ │ 000101d0: 2061 7420 7468 6520 526f 7961 6c20 496e at the Royal In │ │ │ │ 000101e0: 7374 6974 7574 6520 6f66 2054 6563 686e stitute of Techn │ │ │ │ 000101f0: 6f6c 6f67 7920 616e 640a 5570 7073 616c ology and.Uppsal │ │ │ │ 00010200: 6120 556e 6976 6572 7369 7479 2c20 5377 a University, Sw │ │ │ │ ├── html2text {} │ │ │ │ │ @@ -436,15 +436,15 @@ │ │ │ │ │ Pieter Meulenhoff, Teemu Murtola, Sander Pronk, Michael Shirts, Alfons Sijbers, │ │ │ │ │ Balint Soproni, David van der Spoel, Peter Tieleman, Carsten Uphoff, Jon │ │ │ │ │ Vincent, Teemu Virolainen, Christian Wennberg, Maarten Wolf, Artem Zhmurov │ │ │ │ │ Project leaders: Berk Hess, Erik Lindahl │ │ │ │ │ © 1991 – 2000: │ │ │ │ │ Department of Biophysical Chemistry, University of Groningen. │ │ │ │ │ Nijenborgh 4, 9747 AG Groningen, The Netherlands. │ │ │ │ │ -© 2001 – 2025: │ │ │ │ │ +© 2001 – 2024: │ │ │ │ │ The GROMACS development teams at the Royal Institute of Technology │ │ │ │ │ and Uppsala University, Sweden. │ │ │ │ │ This manual is not complete and has no pretension to be so due to lack of time │ │ │ │ │ of the contributors – our first priority is to improve the software. It is │ │ │ │ │ worked on continuously, which in some cases might mean the information is not │ │ │ │ │ entirely correct. │ │ │ │ │ Comments on form and content are welcome, please send them to the _u_s_e_r │ │ │ ├── ./usr/share/doc/gromacs/html/searchindex.js │ │ │ │ ├── js-beautify {} │ │ │ │ │ @@ -490,15 +490,14 @@ │ │ │ │ │ "debian_2024": [0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 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