Diff of the two buildlogs: -- --- b1/build.log 2021-08-14 08:22:20.059433283 +0000 +++ b2/build.log 2021-08-14 10:33:38.306238150 +0000 @@ -1,6 +1,6 @@ I: pbuilder: network access will be disabled during build -I: Current time: Fri Sep 16 00:24:00 -12 2022 -I: pbuilder-time-stamp: 1663331040 +I: Current time: Sat Aug 14 22:22:30 +14 2021 +I: pbuilder-time-stamp: 1628929350 I: Building the build Environment I: extracting base tarball [/var/cache/pbuilder/bullseye-reproducible-base.tgz] I: copying local configuration @@ -16,8 +16,8 @@ I: copying [./libpwiz_3.0.18342-4.debian.tar.xz] I: Extracting source gpgv: unknown type of key resource 'trustedkeys.kbx' -gpgv: keyblock resource '/tmp/dpkg-verify-sig.MkmaEf0A/trustedkeys.kbx': General error -gpgv: Signature made Mon Sep 28 02:23:36 2020 -12 +gpgv: keyblock resource '/tmp/dpkg-verify-sig.IKHrqcmV/trustedkeys.kbx': General error +gpgv: Signature made Tue Sep 29 04:23:36 2020 +14 gpgv: using RSA key B053304E17D6D419DD9B465141AB484D7694CF42 gpgv: Can't check signature: No public key dpkg-source: warning: failed to verify signature on ./libpwiz_3.0.18342-4.dsc @@ -28,135 +28,169 @@ dpkg-source: info: applying gcc-boost-fail-cast-tribool-to-bool-force-it.patch I: using fakeroot in build. I: Installing the build-deps -I: user script /srv/workspace/pbuilder/8143/tmp/hooks/D02_print_environment starting +I: user script /srv/workspace/pbuilder/12673/tmp/hooks/D01_modify_environment starting +debug: Running on codethink16-arm64. +I: Changing host+domainname to test build reproducibility +I: Adding a custom variable just for the fun of it... +I: Changing /bin/sh to bash +Removing 'diversion of /bin/sh to /bin/sh.distrib by dash' +Adding 'diversion of /bin/sh to /bin/sh.distrib by bash' +Removing 'diversion of /usr/share/man/man1/sh.1.gz to /usr/share/man/man1/sh.distrib.1.gz by dash' +Adding 'diversion of /usr/share/man/man1/sh.1.gz to /usr/share/man/man1/sh.distrib.1.gz by bash' +I: Setting pbuilder2's login shell to /bin/bash +I: Setting pbuilder2's GECOS to second user,second room,second work-phone,second home-phone,second other +I: user script /srv/workspace/pbuilder/12673/tmp/hooks/D01_modify_environment finished +I: user script /srv/workspace/pbuilder/12673/tmp/hooks/D02_print_environment starting I: set - BUILDDIR='/build' - BUILDUSERGECOS='first user,first room,first work-phone,first home-phone,first other' - BUILDUSERNAME='pbuilder1' - BUILD_ARCH='arm64' - DEBIAN_FRONTEND='noninteractive' + BASH=/bin/sh + BASHOPTS=checkwinsize:cmdhist:complete_fullquote:extquote:force_fignore:globasciiranges:hostcomplete:interactive_comments:progcomp:promptvars:sourcepath + BASH_ALIASES=() + BASH_ARGC=() + BASH_ARGV=() + BASH_CMDS=() + BASH_LINENO=([0]="12" [1]="0") + BASH_SOURCE=([0]="/tmp/hooks/D02_print_environment" [1]="/tmp/hooks/D02_print_environment") + BASH_VERSINFO=([0]="5" [1]="1" [2]="4" [3]="1" [4]="release" [5]="aarch64-unknown-linux-gnu") + BASH_VERSION='5.1.4(1)-release' + BUILDDIR=/build + BUILDUSERGECOS='second user,second room,second work-phone,second home-phone,second other' + BUILDUSERNAME=pbuilder2 + BUILD_ARCH=arm64 + DEBIAN_FRONTEND=noninteractive DEB_BUILD_OPTIONS='buildinfo=+all 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PBUILDER_PKGLIBDIR=/usr/lib/pbuilder + PBUILDER_SYSCONFDIR=/etc + PIPESTATUS=([0]="0") + POSIXLY_CORRECT=y + PPID=12673 PS4='+ ' - PWD='/' - SHELL='/bin/bash' - SHLVL='2' - SUDO_COMMAND='/usr/bin/timeout -k 18.1h 18h /usr/bin/ionice -c 3 /usr/bin/nice /usr/sbin/pbuilder --build --configfile /srv/reproducible-results/rbuild-debian/tmp.H3cvRpUzdO/pbuilderrc_hMaq --hookdir /etc/pbuilder/first-build-hooks --debbuildopts -b --basetgz /var/cache/pbuilder/bullseye-reproducible-base.tgz --buildresult /srv/reproducible-results/rbuild-debian/tmp.H3cvRpUzdO/b1 --logfile b1/build.log libpwiz_3.0.18342-4.dsc' - SUDO_GID='117' - SUDO_UID='110' - SUDO_USER='jenkins' - TERM='unknown' - TZ='/usr/share/zoneinfo/Etc/GMT+12' - USER='root' - USERNAME='root' - _='/usr/bin/systemd-run' - http_proxy='http://192.168.101.16:3128' + PWD=/ + SHELL=/bin/bash + SHELLOPTS=braceexpand:errexit:hashall:interactive-comments:posix + SHLVL=3 + SUDO_COMMAND='/usr/bin/timeout -k 24.1h 24h /usr/bin/ionice -c 3 /usr/bin/nice -n 11 /usr/bin/unshare --uts -- /usr/sbin/pbuilder --build --configfile /srv/reproducible-results/rbuild-debian/tmp.H3cvRpUzdO/pbuilderrc_JT5t --hookdir /etc/pbuilder/rebuild-hooks --debbuildopts -b --basetgz /var/cache/pbuilder/bullseye-reproducible-base.tgz --buildresult /srv/reproducible-results/rbuild-debian/tmp.H3cvRpUzdO/b2 --logfile b2/build.log --extrapackages usrmerge libpwiz_3.0.18342-4.dsc' + SUDO_GID=117 + SUDO_UID=110 + SUDO_USER=jenkins + TERM=unknown + TZ=/usr/share/zoneinfo/Etc/GMT-14 + UID=0 + USER=root + USERNAME=root + _='I: set' + http_proxy=http://192.168.101.16:3128 I: uname -a - Linux codethink9-arm64 4.15.0-153-generic #160-Ubuntu SMP Thu Jul 29 07:06:07 UTC 2021 aarch64 GNU/Linux + Linux i-capture-the-hostname 4.15.0-153-generic #160-Ubuntu SMP Thu Jul 29 07:06:07 UTC 2021 aarch64 GNU/Linux I: ls -l /bin total 5252 - -rwxr-xr-x 1 root root 1282512 Aug 4 2021 bash - -rwxr-xr-x 3 root root 34808 Jul 20 2020 bunzip2 - -rwxr-xr-x 3 root root 34808 Jul 20 2020 bzcat 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-I: user script /srv/workspace/pbuilder/8143/tmp/hooks/D02_print_environment finished + -rwxr-xr-x 1 root root 1282512 Aug 5 10:25 bash + -rwxr-xr-x 3 root root 34808 Jul 21 2020 bunzip2 + -rwxr-xr-x 3 root root 34808 Jul 21 2020 bzcat + lrwxrwxrwx 1 root root 6 Jul 21 2020 bzcmp -> bzdiff + -rwxr-xr-x 1 root root 2225 Jul 21 2020 bzdiff + lrwxrwxrwx 1 root root 6 Jul 21 2020 bzegrep -> bzgrep + -rwxr-xr-x 1 root root 4877 Sep 5 2019 bzexe + lrwxrwxrwx 1 root root 6 Jul 21 2020 bzfgrep -> bzgrep + -rwxr-xr-x 1 root root 3775 Jul 21 2020 bzgrep + -rwxr-xr-x 3 root root 34808 Jul 21 2020 bzip2 + -rwxr-xr-x 1 root root 14264 Jul 21 2020 bzip2recover + lrwxrwxrwx 1 root root 6 Jul 21 2020 bzless -> bzmore + -rwxr-xr-x 1 root root 1297 Jul 21 2020 bzmore + -rwxr-xr-x 1 root root 39832 Sep 23 2020 cat + -rwxr-xr-x 1 root root 64512 Sep 23 2020 chgrp + -rwxr-xr-x 1 root root 60368 Sep 23 2020 chmod + -rwxr-xr-x 1 root root 64528 Sep 23 2020 chown + -rwxr-xr-x 1 root root 138896 Sep 23 2020 cp 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+ -rwxr-xr-x 1 root root 52720 Feb 8 2020 login + -rwxr-xr-x 1 root root 143088 Sep 23 2020 ls + -rwxr-xr-x 1 root root 161960 Jul 29 09:09 lsblk + -rwxr-xr-x 1 root root 85200 Sep 23 2020 mkdir + -rwxr-xr-x 1 root root 68744 Sep 23 2020 mknod + -rwxr-xr-x 1 root root 43976 Sep 23 2020 mktemp + -rwxr-xr-x 1 root root 51368 Jul 29 09:09 more + -rwsr-xr-x 1 root root 51360 Jul 29 09:09 mount + -rwxr-xr-x 1 root root 14496 Jul 29 09:09 mountpoint + -rwxr-xr-x 1 root root 134808 Sep 23 2020 mv + lrwxrwxrwx 1 root root 8 Nov 8 2019 nisdomainname -> hostname + lrwxrwxrwx 1 root root 14 Apr 19 05:38 pidof -> /sbin/killall5 + -rwxr-xr-x 1 root root 35720 Sep 23 2020 pwd + lrwxrwxrwx 1 root root 4 Aug 5 10:25 rbash -> bash + -rwxr-xr-x 1 root root 43872 Sep 23 2020 readlink + -rwxr-xr-x 1 root root 68592 Sep 23 2020 rm + -rwxr-xr-x 1 root root 43880 Sep 23 2020 rmdir + -rwxr-xr-x 1 root root 19208 Sep 28 2020 run-parts + -rwxr-xr-x 1 root root 114016 Dec 23 2018 sed + lrwxrwxrwx 1 root root 4 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installed Selecting previously unselected package bsdextrautils. (Reading database ... (Reading database ... 5% (Reading database ... 10% (Reading database ... 15% (Reading database ... 20% (Reading database ... 25% (Reading database ... 30% (Reading database ... 35% (Reading database ... 40% (Reading database ... 45% (Reading database ... 50% (Reading database ... 55% (Reading database ... 60% (Reading database ... 65% (Reading database ... 70% (Reading database ... 75% (Reading database ... 80% (Reading database ... 85% (Reading database ... 90% (Reading database ... 95% (Reading database ... 100% (Reading database ... 19646 files and directories currently installed.) @@ -967,9 +1001,42 @@ Building dependency tree... Reading state information... fakeroot is already the newest version (1.25.3-1.1). -0 upgraded, 0 newly installed, 0 to remove and 0 not upgraded. +The following additional packages will be installed: + libfile-find-rule-perl libnumber-compare-perl libtext-glob-perl +The following NEW packages will be installed: + libfile-find-rule-perl libnumber-compare-perl libtext-glob-perl usrmerge +0 upgraded, 4 newly installed, 0 to remove and 0 not upgraded. +Need to get 59.5 kB of archives. +After this operation, 157 kB of additional disk space will be used. +Get:1 http://deb.debian.org/debian bullseye/main arm64 libnumber-compare-perl all 0.03-1.1 [6956 B] +Get:2 http://deb.debian.org/debian bullseye/main arm64 libtext-glob-perl all 0.11-1 [8888 B] +Get:3 http://deb.debian.org/debian bullseye/main arm64 libfile-find-rule-perl all 0.34-1 [30.6 kB] +Get:4 http://deb.debian.org/debian bullseye/main arm64 usrmerge all 25 [13.0 kB] +debconf: delaying package configuration, since apt-utils is not installed +Fetched 59.5 kB in 1s (69.4 kB/s) +Selecting previously unselected package libnumber-compare-perl. +(Reading database ... (Reading database ... 5% (Reading database ... 10% (Reading database ... 15% (Reading database ... 20% (Reading database ... 25% (Reading database ... 30% (Reading database ... 35% (Reading database ... 40% (Reading database ... 45% (Reading database ... 50% (Reading database ... 55% (Reading database ... 60% (Reading database ... 65% (Reading database ... 70% (Reading database ... 75% (Reading database ... 80% (Reading database ... 85% (Reading database ... 90% (Reading database ... 95% (Reading database ... 100% (Reading database ... 40693 files and directories currently installed.) +Preparing to unpack .../libnumber-compare-perl_0.03-1.1_all.deb ... +Unpacking libnumber-compare-perl (0.03-1.1) ... +Selecting previously unselected package libtext-glob-perl. +Preparing to unpack .../libtext-glob-perl_0.11-1_all.deb ... +Unpacking libtext-glob-perl (0.11-1) ... +Selecting previously unselected package libfile-find-rule-perl. +Preparing to unpack .../libfile-find-rule-perl_0.34-1_all.deb ... +Unpacking libfile-find-rule-perl (0.34-1) ... +Selecting previously unselected package usrmerge. +Preparing to unpack .../archives/usrmerge_25_all.deb ... +Unpacking usrmerge (25) ... +Setting up libtext-glob-perl (0.11-1) ... +Setting up libnumber-compare-perl (0.03-1.1) ... +Setting up libfile-find-rule-perl (0.34-1) ... +Setting up usrmerge (25) ... +The system has been successfully converted. +Processing triggers for man-db (2.9.4-2) ... +Not building database; man-db/auto-update is not 'true'. I: Building the package -I: Running cd /build/libpwiz-3.0.18342/ && env PATH="/usr/sbin:/usr/bin:/sbin:/bin:/usr/games" HOME="/nonexistent/first-build" dpkg-buildpackage -us -uc -b && env PATH="/usr/sbin:/usr/bin:/sbin:/bin:/usr/games" HOME="/nonexistent/first-build" dpkg-genchanges -S > ../libpwiz_3.0.18342-4_source.changes +hostname: Temporary failure in name resolution +I: Running cd /build/libpwiz-3.0.18342/ && env PATH="/usr/sbin:/usr/bin:/sbin:/bin:/usr/games:/i/capture/the/path" HOME="/nonexistent/second-build" dpkg-buildpackage -us -uc -b && env PATH="/usr/sbin:/usr/bin:/sbin:/bin:/usr/games:/i/capture/the/path" HOME="/nonexistent/second-build" dpkg-genchanges -S > ../libpwiz_3.0.18342-4_source.changes dpkg-buildpackage: info: source package libpwiz dpkg-buildpackage: info: source version 3.0.18342-4 dpkg-buildpackage: info: source distribution unstable @@ -1048,7 +1115,7 @@ Makefile.am: installing './depcomp' checking for a BSD-compatible install... /usr/bin/install -c checking whether build environment is sane... yes -checking for a thread-safe mkdir -p... /bin/mkdir -p +checking for a thread-safe mkdir -p... /usr/bin/mkdir -p checking for gawk... no checking for mawk... mawk checking whether make sets $(MAKE)... yes @@ -1068,10 +1135,10 @@ checking for aarch64-linux-gnu-gcc option to accept ISO C89... none needed checking whether aarch64-linux-gnu-gcc understands -c and -o together... yes checking dependency style of aarch64-linux-gnu-gcc... gcc3 -checking for a sed that does not truncate output... /bin/sed -checking for grep that handles long lines and -e... /bin/grep -checking for egrep... /bin/grep -E -checking for fgrep... /bin/grep -F +checking for a sed that does not truncate output... /usr/bin/sed +checking for grep that handles long lines and -e... /usr/bin/grep +checking for egrep... /usr/bin/grep -E +checking for fgrep... /usr/bin/grep -F checking for ld used by aarch64-linux-gnu-gcc... /usr/bin/ld checking if the linker (/usr/bin/ld) is GNU ld... yes checking for BSD- or MS-compatible name lister (nm)... /usr/bin/aarch64-linux-gnu-nm -B @@ -1092,8 +1159,8 @@ checking for aarch64-linux-gnu-ranlib... aarch64-linux-gnu-ranlib checking command to parse /usr/bin/aarch64-linux-gnu-nm -B output from aarch64-linux-gnu-gcc object... ok checking for sysroot... no -checking for a working dd... /bin/dd -checking how to truncate binary pipes... /bin/dd bs=4096 count=1 +checking for a working dd... /usr/bin/dd +checking how to truncate binary pipes... /usr/bin/dd bs=4096 count=1 checking for aarch64-linux-gnu-mt... no checking for mt... no checking if : is a manifest tool... no @@ -1270,82 +1337,82 @@ aarch64-linux-gnu-g++ -DPACKAGE_NAME=\"libpwiz\" -DPACKAGE_TARNAME=\"libpwiz\" -DPACKAGE_VERSION=\"3.0.18344\" -DPACKAGE_STRING=\"libpwiz\ 3.0.18344\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"proteowizard-support@lists.sourceforge.net\" -DPACKAGE_URL=\"\" -DPACKAGE=\"libpwiz\" -DVERSION=\"3.0.18344\" -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 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./pwiz_tools/examples/txt2mzml.o libpwiz.la -lboost_thread -lboost_system -pthread -lboost_filesystem -lboost_regex -lboost_serialization -lboost_system -lboost_iostreams -lboost_date_time -lboost_program_options -lboost_chrono -lboost_thread -lboost_system -pthread -lboost_filesystem -lboost_regex -lboost_serialization -lboost_system -lboost_iostreams -lboost_date_time -lboost_program_options -lboost_chrono +/bin/sh ./libtool --tag=CXX --mode=link aarch64-linux-gnu-g++ -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/libpwiz-3.0.18342=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -L/usr/lib/aarch64-linux-gnu -Wl,-z,relro -Wl,-z,now -o txt2mzml ./pwiz_tools/examples/txt2mzml.o libpwiz.la -lboost_thread -lboost_system -pthread -lboost_filesystem -lboost_regex -lboost_serialization -lboost_system -lboost_iostreams -lboost_date_time -lboost_program_options -lboost_chrono -lboost_thread -lboost_system -pthread -lboost_filesystem -lboost_regex 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"/build/libpwiz-3.0.18342/debian/build/libraries/libsvm-3.0" -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/libpwiz-3.0.18342=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -MT pwiz_tools/examples/write_traml_example_files.o -MD -MP -MF $depbase.Tpo -c -o pwiz_tools/examples/write_traml_example_files.o pwiz_tools/examples/write_traml_example_files.cpp &&\ mv -f $depbase.Tpo $depbase.Po -/bin/bash ./libtool --tag=CXX --mode=link aarch64-linux-gnu-g++ -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/libpwiz-3.0.18342=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -L/usr/lib/aarch64-linux-gnu -Wl,-z,relro -Wl,-z,now -o write_traml_example_files ./pwiz_tools/examples/write_traml_example_files.o libpwiz.la -lboost_thread -lboost_system -pthread -lboost_filesystem -lboost_regex -lboost_serialization -lboost_system -lboost_iostreams -lboost_date_time -lboost_program_options -lboost_chrono -lboost_thread -lboost_system -pthread -lboost_filesystem -lboost_regex -lboost_serialization -lboost_system -lboost_iostreams -lboost_date_time -lboost_program_options -lboost_chrono +/bin/sh ./libtool --tag=CXX --mode=link aarch64-linux-gnu-g++ -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/libpwiz-3.0.18342=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -L/usr/lib/aarch64-linux-gnu -Wl,-z,relro -Wl,-z,now -o write_traml_example_files ./pwiz_tools/examples/write_traml_example_files.o libpwiz.la -lboost_thread -lboost_system -pthread -lboost_filesystem -lboost_regex -lboost_serialization -lboost_system -lboost_iostreams -lboost_date_time -lboost_program_options -lboost_chrono -lboost_thread -lboost_system -pthread -lboost_filesystem -lboost_regex -lboost_serialization -lboost_system -lboost_iostreams -lboost_date_time -lboost_program_options -lboost_chrono libtool: link: aarch64-linux-gnu-g++ -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/libpwiz-3.0.18342=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -Wl,-z -Wl,relro -Wl,-z -Wl,now -o .libs/write_traml_example_files ./pwiz_tools/examples/write_traml_example_files.o -pthread -pthread -L/usr/lib/aarch64-linux-gnu ./.libs/libpwiz.so -lboost_thread -lboost_filesystem -lboost_regex -lboost_serialization -lboost_system -lboost_iostreams -lboost_date_time -lboost_program_options -lboost_chrono -pthread make[1]: Leaving directory '/build/libpwiz-3.0.18342/debian/build' make[1]: Entering directory '/build/libpwiz-3.0.18342/debian/build' make[2]: Entering directory '/build/libpwiz-3.0.18342/debian/build' - /bin/mkdir -p '/build/libpwiz-3.0.18342/debian/build/usr/lib' - /bin/bash ./libtool --mode=install /usr/bin/install -c libpwiz.la '/build/libpwiz-3.0.18342/debian/build/usr/lib' + /usr/bin/mkdir -p '/build/libpwiz-3.0.18342/debian/build/usr/lib' + /bin/sh ./libtool --mode=install /usr/bin/install -c libpwiz.la '/build/libpwiz-3.0.18342/debian/build/usr/lib' libtool: install: /usr/bin/install -c .libs/libpwiz.so.3.0.0 /build/libpwiz-3.0.18342/debian/build/usr/lib/libpwiz.so.3.0.0 libtool: install: (cd /build/libpwiz-3.0.18342/debian/build/usr/lib && { ln -s -f libpwiz.so.3.0.0 libpwiz.so.3 || { rm -f libpwiz.so.3 && ln -s libpwiz.so.3.0.0 libpwiz.so.3; }; }) libtool: install: (cd /build/libpwiz-3.0.18342/debian/build/usr/lib && { ln -s -f libpwiz.so.3.0.0 libpwiz.so || { rm -f libpwiz.so && ln -s libpwiz.so.3.0.0 libpwiz.so; }; }) @@ -3372,8 +3439,8 @@ libtool: install: chmod 644 /build/libpwiz-3.0.18342/debian/build/usr/lib/libpwiz.a libtool: install: aarch64-linux-gnu-ranlib /build/libpwiz-3.0.18342/debian/build/usr/lib/libpwiz.a libtool: warning: remember to run 'libtool --finish /usr/lib' - /bin/mkdir -p '/build/libpwiz-3.0.18342/debian/build/usr/bin' - /bin/bash ./libtool --mode=install /usr/bin/install -c txt2mzml msconvert mscat hello_analyzer_2 idconvert write_example_files hello_msdata write_mzid_example_files hello_analyzer write_proteome_example_files pepcat write_traml_example_files '/build/libpwiz-3.0.18342/debian/build/usr/bin' + /usr/bin/mkdir -p '/build/libpwiz-3.0.18342/debian/build/usr/bin' + /bin/sh ./libtool --mode=install /usr/bin/install -c txt2mzml msconvert mscat hello_analyzer_2 idconvert write_example_files hello_msdata write_mzid_example_files hello_analyzer write_proteome_example_files pepcat write_traml_example_files '/build/libpwiz-3.0.18342/debian/build/usr/bin' libtool: warning: 'libpwiz.la' has not been installed in '/usr/lib' libtool: install: /usr/bin/install -c .libs/txt2mzml /build/libpwiz-3.0.18342/debian/build/usr/bin/txt2mzml libtool: warning: 'libpwiz.la' has not been installed in '/usr/lib' @@ -4889,7 +4956,7 @@ /build/libpwiz-3.0.18342/pwiz/data/proteome/Peptide.hpp:166: warning: Unsupported xml/html tag found /build/libpwiz-3.0.18342/pwiz/data/proteome/Peptide.hpp:168: warning: Unsupported xml/html tag found /build/libpwiz-3.0.18342/pwiz/data/proteome/Peptide.hpp:169: warning: Unsupported xml/html tag found -sh: 1: latex: not found +sh: line 1: latex: command not found error: Problems running latex. Check your installation or look for typos in _formulas.tex and check _formulas.log! leton.hpp... Parsing file /build/libpwiz-3.0.18342/pwiz/utility/misc/Singleton.hpp... @@ -7027,7 +7094,7 @@ Makefile.am: installing './depcomp' checking for a BSD-compatible install... /usr/bin/install -c checking whether build environment is sane... yes -checking for a thread-safe mkdir -p... /bin/mkdir -p +checking for a thread-safe mkdir -p... /usr/bin/mkdir -p checking for gawk... no checking for mawk... mawk checking whether make sets $(MAKE)... yes @@ -7047,10 +7114,10 @@ checking for aarch64-linux-gnu-gcc option to accept ISO C89... none needed checking whether aarch64-linux-gnu-gcc understands -c and -o together... yes checking dependency style of aarch64-linux-gnu-gcc... gcc3 -checking for a sed that does not truncate output... /bin/sed -checking for grep that handles long lines and -e... /bin/grep -checking for egrep... /bin/grep -E -checking for fgrep... /bin/grep -F +checking for a sed that does not truncate output... /usr/bin/sed +checking for grep that handles long lines and -e... /usr/bin/grep +checking for egrep... /usr/bin/grep -E +checking for fgrep... /usr/bin/grep -F checking for ld used by aarch64-linux-gnu-gcc... /usr/bin/ld checking if the linker (/usr/bin/ld) is GNU ld... yes checking for BSD- or MS-compatible name lister (nm)... /usr/bin/aarch64-linux-gnu-nm -B @@ -7071,8 +7138,8 @@ checking for aarch64-linux-gnu-ranlib... aarch64-linux-gnu-ranlib checking command to parse /usr/bin/aarch64-linux-gnu-nm -B output from aarch64-linux-gnu-gcc object... ok checking for sysroot... no -checking for a working dd... /bin/dd -checking how to truncate binary pipes... /bin/dd bs=4096 count=1 +checking for a working dd... /usr/bin/dd +checking how to truncate binary pipes... /usr/bin/dd bs=4096 count=1 checking for aarch64-linux-gnu-mt... no checking for mt... no checking if : is a manifest tool... no @@ -7249,8 +7316,8 @@ make[1]: Leaving directory '/build/libpwiz-3.0.18342/debian/build' make[1]: Entering directory '/build/libpwiz-3.0.18342/debian/build' make[2]: Entering directory '/build/libpwiz-3.0.18342/debian/build' - /bin/mkdir -p '/build/libpwiz-3.0.18342/debian/build/usr/lib' - /bin/bash ./libtool --mode=install /usr/bin/install -c libpwiz.la '/build/libpwiz-3.0.18342/debian/build/usr/lib' + /usr/bin/mkdir -p '/build/libpwiz-3.0.18342/debian/build/usr/lib' + /bin/sh ./libtool --mode=install /usr/bin/install -c libpwiz.la '/build/libpwiz-3.0.18342/debian/build/usr/lib' libtool: install: /usr/bin/install -c .libs/libpwiz.so.3.0.0 /build/libpwiz-3.0.18342/debian/build/usr/lib/libpwiz.so.3.0.0 libtool: install: (cd /build/libpwiz-3.0.18342/debian/build/usr/lib && { ln -s -f libpwiz.so.3.0.0 libpwiz.so.3 || { rm -f libpwiz.so.3 && ln -s libpwiz.so.3.0.0 libpwiz.so.3; }; }) libtool: install: (cd /build/libpwiz-3.0.18342/debian/build/usr/lib && { ln -s -f libpwiz.so.3.0.0 libpwiz.so || { rm -f libpwiz.so && ln -s libpwiz.so.3.0.0 libpwiz.so; }; }) @@ -7259,8 +7326,8 @@ libtool: install: chmod 644 /build/libpwiz-3.0.18342/debian/build/usr/lib/libpwiz.a libtool: install: aarch64-linux-gnu-ranlib /build/libpwiz-3.0.18342/debian/build/usr/lib/libpwiz.a libtool: warning: remember to run 'libtool --finish /usr/lib' - /bin/mkdir -p '/build/libpwiz-3.0.18342/debian/build/usr/bin' - /bin/bash ./libtool --mode=install /usr/bin/install -c txt2mzml msconvert mscat hello_analyzer_2 idconvert write_example_files hello_msdata write_mzid_example_files hello_analyzer write_proteome_example_files pepcat write_traml_example_files '/build/libpwiz-3.0.18342/debian/build/usr/bin' + /usr/bin/mkdir -p '/build/libpwiz-3.0.18342/debian/build/usr/bin' + /bin/sh ./libtool --mode=install /usr/bin/install -c txt2mzml msconvert mscat hello_analyzer_2 idconvert write_example_files hello_msdata write_mzid_example_files hello_analyzer write_proteome_example_files pepcat write_traml_example_files '/build/libpwiz-3.0.18342/debian/build/usr/bin' libtool: warning: 'libpwiz.la' has not been installed in '/usr/lib' libtool: install: /usr/bin/install -c .libs/txt2mzml /build/libpwiz-3.0.18342/debian/build/usr/bin/txt2mzml libtool: warning: 'libpwiz.la' has not been installed in '/usr/lib' @@ -7695,21 +7762,21 @@ man-recode --to-code UTF-8 --suffix .dh-new debian/libpwiz-tools/usr/share/man/man1/mscat.1 man-recode --to-code UTF-8 --suffix .dh-new debian/libpwiz-tools/usr/share/man/man1/msconvert.1 man-recode --to-code UTF-8 --suffix .dh-new debian/libpwiz-tools/usr/share/man/man1/txt2mzml.1 + mv debian/libpwiz3/usr/share/man/man3/libpwiz.3.dh-new debian/libpwiz3/usr/share/man/man3/libpwiz.3 + chmod 0644 -- debian/libpwiz3/usr/share/man/man3/libpwiz.3 mv debian/libpwiz-tools/usr/share/man/man1/mscat.1.dh-new debian/libpwiz-tools/usr/share/man/man1/mscat.1 chmod 0644 -- debian/libpwiz-tools/usr/share/man/man1/mscat.1 mv debian/libpwiz-tools/usr/share/man/man1/msconvert.1.dh-new debian/libpwiz-tools/usr/share/man/man1/msconvert.1 chmod 0644 -- debian/libpwiz-tools/usr/share/man/man1/msconvert.1 - mv debian/libpwiz-tools/usr/share/man/man1/idconvert.1.dh-new debian/libpwiz-tools/usr/share/man/man1/idconvert.1 - chmod 0644 -- debian/libpwiz-tools/usr/share/man/man1/idconvert.1 mv debian/libpwiz-tools/usr/share/man/man1/txt2mzml.1.dh-new debian/libpwiz-tools/usr/share/man/man1/txt2mzml.1 chmod 0644 -- debian/libpwiz-tools/usr/share/man/man1/txt2mzml.1 - mv debian/libpwiz3/usr/share/man/man3/libpwiz.3.dh-new debian/libpwiz3/usr/share/man/man3/libpwiz.3 - chmod 0644 -- debian/libpwiz3/usr/share/man/man3/libpwiz.3 + mv debian/libpwiz-tools/usr/share/man/man1/idconvert.1.dh-new debian/libpwiz-tools/usr/share/man/man1/idconvert.1 + chmod 0644 -- debian/libpwiz-tools/usr/share/man/man1/idconvert.1 dh_strip -a - install -d debian/.debhelper/libpwiz-tools/dbgsym-root/usr/lib/debug/.build-id/a3 - objcopy --only-keep-debug --compress-debug-sections debian/libpwiz-tools/usr/bin/txt2mzml debian/.debhelper/libpwiz-tools/dbgsym-root/usr/lib/debug/.build-id/a3/4736234042a191775612eb4a065c4afd5787fd.debug install -d debian/.debhelper/libpwiz3/dbgsym-root/usr/lib/debug/.build-id/21 objcopy --only-keep-debug --compress-debug-sections debian/libpwiz3/usr/lib/libpwiz.so.3.0.0 debian/.debhelper/libpwiz3/dbgsym-root/usr/lib/debug/.build-id/21/c879735ba79f6ca9d672acd2408fef36afffa3.debug + install -d debian/.debhelper/libpwiz-tools/dbgsym-root/usr/lib/debug/.build-id/a3 + objcopy --only-keep-debug --compress-debug-sections debian/libpwiz-tools/usr/bin/txt2mzml debian/.debhelper/libpwiz-tools/dbgsym-root/usr/lib/debug/.build-id/a3/4736234042a191775612eb4a065c4afd5787fd.debug strip --strip-debug --remove-section=.comment --remove-section=.note --enable-deterministic-archives -R .gnu.lto_\* -R .gnu.debuglto_\* -N __gnu_lto_slim -N __gnu_lto_v1 debian/libpwiz-dev/usr/lib/libpwiz.a chmod 0644 -- debian/.debhelper/libpwiz-tools/dbgsym-root/usr/lib/debug/.build-id/a3/4736234042a191775612eb4a065c4afd5787fd.debug chown 0:0 -- debian/.debhelper/libpwiz-tools/dbgsym-root/usr/lib/debug/.build-id/a3/4736234042a191775612eb4a065c4afd5787fd.debug @@ -7743,15 +7810,15 @@ ln -s libpwiz3 debian/.debhelper/libpwiz3/dbgsym-root/usr/share/doc/libpwiz3-dbgsym dh_compress -av -Xexample-files cd debian/libpwiz-dev - cd debian/libpwiz-tools cd debian/libpwiz3 + cd debian/libpwiz-tools + chmod a-x usr/share/doc/libpwiz3/changelog.Debian usr/share/man/man3/libpwiz.3 + chmod a-x usr/share/doc/libpwiz-tools/changelog.Debian usr/share/man/man1/idconvert.1 usr/share/man/man1/mscat.1 usr/share/man/man1/msconvert.1 usr/share/man/man1/txt2mzml.1 chmod a-x usr/share/doc/libpwiz-dev/changelog.Debian + gzip -9nf usr/share/doc/libpwiz3/changelog.Debian usr/share/man/man3/libpwiz.3 + gzip -9nf usr/share/doc/libpwiz-tools/changelog.Debian usr/share/man/man1/idconvert.1 usr/share/man/man1/mscat.1 usr/share/man/man1/msconvert.1 usr/share/man/man1/txt2mzml.1 gzip -9nf usr/share/doc/libpwiz-dev/changelog.Debian - chmod a-x usr/share/doc/libpwiz-tools/changelog.Debian usr/share/man/man1/idconvert.1 usr/share/man/man1/mscat.1 usr/share/man/man1/msconvert.1 usr/share/man/man1/txt2mzml.1 cd '/build/libpwiz-3.0.18342' - chmod a-x usr/share/doc/libpwiz3/changelog.Debian usr/share/man/man3/libpwiz.3 - gzip -9nf usr/share/doc/libpwiz-tools/changelog.Debian usr/share/man/man1/idconvert.1 usr/share/man/man1/mscat.1 usr/share/man/man1/msconvert.1 usr/share/man/man1/txt2mzml.1 - gzip -9nf usr/share/doc/libpwiz3/changelog.Debian usr/share/man/man3/libpwiz.3 cd '/build/libpwiz-3.0.18342' cd '/build/libpwiz-3.0.18342' dh_makeshlibs -a @@ -7777,7 +7844,7 @@ dpkg-gensymbols: debug: Merging symbols from /build/libpwiz-3.0.18342/debian/build/usr/lib/libpwiz.so.3.0.0 as libpwiz.so.3 dpkg-gensymbols: debug: Storing symbols in /build/libpwiz-3.0.18342/debian/libpwiz3/DEBIAN/symbols. --- new_symbol_file (libpwiz3_3.0.0_arm64) -+++ dpkg-gensymbols880o4I 2022-09-16 02:42:33.543363240 -1200 ++++ dpkg-gensymbolsj1Vjmt 2021-08-15 00:32:13.202770821 +1400 @@ -0,0 +1,12683 @@ +libpwiz.so.3 libpwiz3 #MINVER# + PERSON_DOC_OWNER@Base 3.0.0 @@ -20470,16 +20537,16 @@ find debian/libpwiz-tools -true -print0 2>/dev/null | xargs -0r chown --no-dereference 0:0 find debian/libpwiz3 ! -type l -a -true -a -true -print0 2>/dev/null | xargs -0r chmod go=rX,u+rw,a-s find debian/libpwiz-tools ! -type l -a -true -a -true -print0 2>/dev/null | xargs -0r chmod go=rX,u+rw,a-s - find debian/libpwiz-tools/usr/share/doc -type f -a -true -a ! -regex 'debian/libpwiz-tools/usr/share/doc/[^/]*/examples/.*' -print0 2>/dev/null | xargs -0r chmod 0644 find debian/libpwiz3/usr/share/doc -type f -a -true -a ! -regex 'debian/libpwiz3/usr/share/doc/[^/]*/examples/.*' -print0 2>/dev/null | xargs -0r chmod 0644 + find debian/libpwiz-tools/usr/share/doc -type f -a -true -a ! -regex 'debian/libpwiz-tools/usr/share/doc/[^/]*/examples/.*' -print0 2>/dev/null | xargs -0r chmod 0644 + find debian/libpwiz3/usr/share/doc -type d -a -true -a -true -print0 2>/dev/null | xargs -0r chmod 0755 find debian/libpwiz-tools/usr/share/doc -type d -a -true -a -true -print0 2>/dev/null | xargs -0r chmod 0755 + find debian/libpwiz-dev ! -type l -a -true -a -true -print0 2>/dev/null | xargs -0r chmod go=rX,u+rw,a-s + find debian/libpwiz3/usr/share/man -type f -a -true -a -true -print0 2>/dev/null | xargs -0r chmod 0644 find debian/libpwiz-tools/usr/share/man -type f -a -true -a -true -print0 2>/dev/null | xargs -0r chmod 0644 - find debian/libpwiz3/usr/share/doc -type d -a -true -a -true -print0 2>/dev/null | xargs -0r chmod 0755 + find debian/libpwiz3 -type f \( -name '*.so.*' -o -name '*.so' -o -name '*.la' -o -name '*.a' -o -name '*.js' -o -name '*.css' -o -name '*.scss' -o -name '*.sass' -o -name '*.jpeg' -o -name '*.jpg' -o -name '*.png' -o -name '*.gif' -o -name '*.cmxs' -o -name '*.node' \) -a -true -a -true -print0 2>/dev/null | xargs -0r chmod 0644 find debian/libpwiz-tools -type f \( -name '*.so.*' -o -name '*.so' -o -name '*.la' -o -name '*.a' -o -name '*.js' -o -name '*.css' -o -name '*.scss' -o -name '*.sass' -o -name '*.jpeg' -o -name '*.jpg' -o -name '*.png' -o -name '*.gif' -o -name '*.cmxs' -o -name '*.node' \) -a -true -a -true -print0 2>/dev/null | xargs -0r chmod 0644 - find debian/libpwiz3/usr/share/man -type f -a -true -a -true -print0 2>/dev/null | xargs -0r chmod 0644 find debian/libpwiz-tools/usr/bin -type f -a -true -a -true -print0 2>/dev/null | xargs -0r chmod a+x - find debian/libpwiz3 -type f \( -name '*.so.*' -o -name '*.so' -o -name '*.la' -o -name '*.a' -o -name '*.js' -o -name '*.css' -o -name '*.scss' -o -name '*.sass' -o -name '*.jpeg' -o -name '*.jpg' -o -name '*.png' -o -name '*.gif' -o -name '*.cmxs' -o -name '*.node' \) -a -true -a -true -print0 2>/dev/null | xargs -0r chmod 0644 - find debian/libpwiz-dev ! -type l -a -true -a -true -print0 2>/dev/null | xargs -0r chmod go=rX,u+rw,a-s find debian/libpwiz3/usr/lib -type f -name '*.ali' -a -true -a -true -print0 2>/dev/null | xargs -0r chmod uga-w find debian/libpwiz-dev/usr/share/doc -type f -a -true -a ! -regex 'debian/libpwiz-dev/usr/share/doc/[^/]*/examples/.*' -print0 2>/dev/null | xargs -0r chmod 0644 find debian/libpwiz-dev/usr/share/doc -type d -a -true -a -true -print0 2>/dev/null | xargs -0r chmod 0755 @@ -20492,16 +20559,16 @@ dpkg-shlibdeps -Tdebian/libpwiz-tools.substvars debian/libpwiz-tools/usr/bin/idconvert debian/libpwiz-tools/usr/bin/mscat debian/libpwiz-tools/usr/bin/msconvert debian/libpwiz-tools/usr/bin/txt2mzml dpkg-shlibdeps: warning: deprecated use of LD_LIBRARY_PATH with private library directory which interferes with cross-building, please use -l option instead dpkg-shlibdeps: warning: deprecated use of LD_LIBRARY_PATH with private library directory which interferes with cross-building, please use -l option instead -dpkg-shlibdeps: warning: symbol inflateInit2_ used by debian/libpwiz3/usr/lib/libpwiz.so.3.0.0 found in none of the libraries -dpkg-shlibdeps: warning: symbol inflateReset used by debian/libpwiz3/usr/lib/libpwiz.so.3.0.0 found in none of the libraries -dpkg-shlibdeps: warning: symbol compress used by debian/libpwiz3/usr/lib/libpwiz.so.3.0.0 found in none of the libraries +dpkg-shlibdeps: warning: symbol pthread_condattr_setclock used by debian/libpwiz3/usr/lib/libpwiz.so.3.0.0 found in none of the libraries dpkg-shlibdeps: warning: symbol uncompress used by debian/libpwiz3/usr/lib/libpwiz.so.3.0.0 found in none of the libraries -dpkg-shlibdeps: warning: symbol crc32 used by debian/libpwiz3/usr/lib/libpwiz.so.3.0.0 found in none of the libraries +dpkg-shlibdeps: warning: symbol compressBound used by debian/libpwiz3/usr/lib/libpwiz.so.3.0.0 found in none of the libraries +dpkg-shlibdeps: warning: symbol inflate used by debian/libpwiz3/usr/lib/libpwiz.so.3.0.0 found in none of the libraries dpkg-shlibdeps: warning: symbol pthread_mutexattr_init used by debian/libpwiz3/usr/lib/libpwiz.so.3.0.0 found in none of the libraries +dpkg-shlibdeps: warning: symbol inflateInit2_ used by debian/libpwiz3/usr/lib/libpwiz.so.3.0.0 found in none of the libraries +dpkg-shlibdeps: warning: symbol compress used by debian/libpwiz3/usr/lib/libpwiz.so.3.0.0 found in none of the libraries dpkg-shlibdeps: warning: symbol inflateEnd used by debian/libpwiz3/usr/lib/libpwiz.so.3.0.0 found in none of the libraries -dpkg-shlibdeps: warning: symbol pthread_condattr_setclock used by debian/libpwiz3/usr/lib/libpwiz.so.3.0.0 found in none of the libraries -dpkg-shlibdeps: warning: symbol inflate used by debian/libpwiz3/usr/lib/libpwiz.so.3.0.0 found in none of the libraries -dpkg-shlibdeps: warning: symbol inflateCopy used by debian/libpwiz3/usr/lib/libpwiz.so.3.0.0 found in none of the libraries +dpkg-shlibdeps: warning: symbol pthread_mutexattr_destroy used by debian/libpwiz3/usr/lib/libpwiz.so.3.0.0 found in none of the libraries +dpkg-shlibdeps: warning: symbol pthread_mutexattr_settype used by debian/libpwiz3/usr/lib/libpwiz.so.3.0.0 found in none of the libraries dpkg-shlibdeps: warning: 3 other similar warnings have been skipped (use -v to see them all) dh_gencontrol -a echo misc:Depends= >> debian/libpwiz-dev.substvars @@ -20516,18 +20583,18 @@ install -d debian/.debhelper/libpwiz3/dbgsym-root/DEBIAN dpkg-gencontrol -plibpwiz3 -ldebian/changelog -Tdebian/libpwiz3.substvars -Pdebian/.debhelper/libpwiz3/dbgsym-root -UPre-Depends -URecommends -USuggests -UEnhances -UProvides -UEssential -UConflicts -DPriority=optional -UHomepage -UImportant -UBuilt-Using -DAuto-Built-Package=debug-symbols -UProtected -DPackage=libpwiz3-dbgsym "-DDepends=libpwiz3 (= \${binary:Version})" "-DDescription=debug symbols for libpwiz3" -DBuild-Ids=21c879735ba79f6ca9d672acd2408fef36afffa3 -DSection=debug -UMulti-Arch -UReplaces -UBreaks dpkg-gencontrol: warning: Depends field of package libpwiz-dev: substitution variable ${shlibs:Depends} used, but is not defined - chmod 0644 -- debian/.debhelper/libpwiz-tools/dbgsym-root/DEBIAN/control - chown 0:0 -- debian/.debhelper/libpwiz-tools/dbgsym-root/DEBIAN/control - dpkg-gencontrol -plibpwiz-tools -ldebian/changelog -Tdebian/libpwiz-tools.substvars -Pdebian/libpwiz-tools chmod 0644 -- debian/.debhelper/libpwiz3/dbgsym-root/DEBIAN/control chown 0:0 -- debian/.debhelper/libpwiz3/dbgsym-root/DEBIAN/control dpkg-gencontrol -plibpwiz3 -ldebian/changelog -Tdebian/libpwiz3.substvars -Pdebian/libpwiz3 + chmod 0644 -- debian/.debhelper/libpwiz-tools/dbgsym-root/DEBIAN/control + chown 0:0 -- debian/.debhelper/libpwiz-tools/dbgsym-root/DEBIAN/control + dpkg-gencontrol -plibpwiz-tools -ldebian/changelog -Tdebian/libpwiz-tools.substvars -Pdebian/libpwiz-tools chmod 0644 -- debian/libpwiz-dev/DEBIAN/control chown 0:0 -- debian/libpwiz-dev/DEBIAN/control - chmod 0644 -- debian/libpwiz-tools/DEBIAN/control - chown 0:0 -- debian/libpwiz-tools/DEBIAN/control chmod 0644 -- debian/libpwiz3/DEBIAN/control chown 0:0 -- debian/libpwiz3/DEBIAN/control + chmod 0644 -- debian/libpwiz-tools/DEBIAN/control + chown 0:0 -- debian/libpwiz-tools/DEBIAN/control dh_md5sums -a cd debian/libpwiz-tools >/dev/null && xargs -r0 md5sum | perl -pe 'if (s@^\\@@) { s/\\\\/\\/g; }' > DEBIAN/md5sums cd debian/libpwiz3 >/dev/null && xargs -r0 md5sum | perl -pe 'if (s@^\\@@) { s/\\\\/\\/g; }' > DEBIAN/md5sums @@ -20535,10 +20602,10 @@ chmod 0644 -- debian/libpwiz-tools/DEBIAN/md5sums chown 0:0 -- debian/libpwiz-tools/DEBIAN/md5sums cd debian/.debhelper/libpwiz-tools/dbgsym-root >/dev/null && xargs -r0 md5sum | perl -pe 'if (s@^\\@@) { s/\\\\/\\/g; }' > DEBIAN/md5sums - chmod 0644 -- debian/libpwiz3/DEBIAN/md5sums - chown 0:0 -- debian/libpwiz3/DEBIAN/md5sums chmod 0644 -- debian/.debhelper/libpwiz-tools/dbgsym-root/DEBIAN/md5sums chown 0:0 -- debian/.debhelper/libpwiz-tools/dbgsym-root/DEBIAN/md5sums + chmod 0644 -- debian/libpwiz3/DEBIAN/md5sums + chown 0:0 -- debian/libpwiz3/DEBIAN/md5sums cd debian/.debhelper/libpwiz3/dbgsym-root >/dev/null && xargs -r0 md5sum | perl -pe 'if (s@^\\@@) { s/\\\\/\\/g; }' > DEBIAN/md5sums chmod 0644 -- debian/libpwiz-dev/DEBIAN/md5sums chown 0:0 -- debian/libpwiz-dev/DEBIAN/md5sums @@ -20546,15 +20613,15 @@ chown 0:0 -- debian/.debhelper/libpwiz3/dbgsym-root/DEBIAN/md5sums dh_builddeb -a dpkg-deb --build debian/libpwiz-dev .. - dpkg-deb --build debian/.debhelper/libpwiz-tools/dbgsym-root .. dpkg-deb --build debian/libpwiz3 .. - dpkg-deb --build debian/libpwiz-tools .. dpkg-deb --build debian/.debhelper/libpwiz3/dbgsym-root .. + dpkg-deb --build debian/libpwiz-tools .. + dpkg-deb --build debian/.debhelper/libpwiz-tools/dbgsym-root .. dpkg-deb: building package 'libpwiz-dev' in '../libpwiz-dev_3.0.18342-4_arm64.deb'. -dpkg-deb: building package 'libpwiz-tools' in '../libpwiz-tools_3.0.18342-4_arm64.deb'. +dpkg-deb: building package 'libpwiz3-dbgsym' in '../libpwiz3-dbgsym_3.0.18342-4_arm64.deb'. dpkg-deb: building package 'libpwiz3' in '../libpwiz3_3.0.18342-4_arm64.deb'. dpkg-deb: building package 'libpwiz-tools-dbgsym' in '../libpwiz-tools-dbgsym_3.0.18342-4_arm64.deb'. -dpkg-deb: building package 'libpwiz3-dbgsym' in '../libpwiz3-dbgsym_3.0.18342-4_arm64.deb'. +dpkg-deb: building package 'libpwiz-tools' in '../libpwiz-tools_3.0.18342-4_arm64.deb'. entering the build-indep-stamp target cd doc/dox && doxygen warning: Tag 'USE_WINDOWS_ENCODING' at line 11 of file 'Doxyfile' has become obsolete. @@ -21684,7 +21751,7 @@ /build/libpwiz-3.0.18342/pwiz/data/proteome/Peptide.hpp:166: warning: Unsupported xml/html tag found /build/libpwiz-3.0.18342/pwiz/data/proteome/Peptide.hpp:168: warning: Unsupported xml/html tag found /build/libpwiz-3.0.18342/pwiz/data/proteome/Peptide.hpp:169: warning: Unsupported xml/html tag found -sh: 1: latex: not found +sh: line 1: latex: command not found error: Problems running latex. Check your installation or look for typos in _formulas.tex and check _formulas.log! leton.hpp... Parsing file /build/libpwiz-3.0.18342/pwiz/utility/misc/Singleton.hpp... @@ -23836,12 +23903,14 @@ dpkg-buildpackage: info: binary-only upload (no source included) dpkg-genchanges: info: not including original source code in upload I: copying local configuration +I: user script /srv/workspace/pbuilder/12673/tmp/hooks/B01_cleanup starting +I: user script /srv/workspace/pbuilder/12673/tmp/hooks/B01_cleanup finished I: unmounting dev/ptmx filesystem I: unmounting dev/pts filesystem I: unmounting dev/shm filesystem I: unmounting proc filesystem I: unmounting sys filesystem I: cleaning the build env -I: removing directory /srv/workspace/pbuilder/8143 and its subdirectories -I: Current time: Fri Sep 16 02:45:17 -12 2022 -I: pbuilder-time-stamp: 1663339517 +I: removing directory /srv/workspace/pbuilder/12673 and its subdirectories +I: Current time: Sun Aug 15 00:33:37 +14 2021 +I: pbuilder-time-stamp: 1628937217